Формами самоуправления МОДО СЮН являются:

1. Совет МОДО СЮН.
2. Общее собрание трудового коллектива.
3. Педагогический совет.

1.Совет МОДО СЮН:
Деятельность Совета МОДО СЮН регламентируется Уставом и Положением о Совете МОДО СЮН;

Совет МОДО СЮН:
- определяет стратегию развития станции юннатов;
- утверждает основные направления развития станции юннатов;
- разрабатывает меры по совершенствованию содержания образования, внедрению инновациоых технологий;
- ведает вопросами этики и гласности;

- контролирует расходование средств, являющихся собственностью станции юннатов;
- утверждает отдельные локальные акты, регулирующие деятельность станции юннатов;
- заслушивает отчеты директора о работе МОДО СЮН;
- создает временные или постоянные комиссии, советы по различным направлениям работы станции юннатов, устанавливает их полномочия;
- участвует в разработке и согласовывает локальные акты станции юннатов, устанавливающие виды, размеры, условия и порядок произведения выплат стимулирующего характера работникам станции юннатов, показатели и критерии оценки качества и результативности труда работников станции юннатов;
- осуществляет другие функции, предусмотренные Положением о Совете МОДО СЮН.

Заседания Совета МОДО СЮН созываются по мере необходимости, но не реже одного раза в полугодие. Решения Совета МОДО СЮН принимаются открытым голосованием. Решения Совета МОДО СЮН являются правомочными, если на его заседании присутствовало не менее двух третей состава и за них проголосовало не менее двух третей присутствующих. Решения Совета МОДО СЮН, принятые в пределах его полномочий, являются обязательными для директора МОДО СЮН и всех членов трудового коллектива станции юннатов.

2. Общее собрание трудового коллектива:
Трудовой коллектив станции юннатов составляют все граждане, участвующие своим трудом в ее деятельности на основе трудового договора. Полномочия трудового коллектива станции юннатов осуществляется общим собранием трудового коллектива.

Общее собрание трудового коллектива:
- рассматривает и принимает Устав МОДО СЮН, изменения и дополнения, вносимые в него;
- заслушивает отчет директора о работе МОДО СЮН;
- утверждает план развития станции юннатов;
- рассматривает и принимает Правила внутреннего трудового распорядка, другие локальные акты, принимает решение о заключении коллективного договора;
- рассматривает и утверждает кандидатуры на представление педагогических работников к государственным и отраслевым наградам.

Общее собрание трудового коллектива проводится не реже 2-х раз в год. Решения общего собрания трудового коллектива являются правомочными, если на нем присутствовало не менее 2/3 состава и за них проголосовало не менее половины присутствующих. Решения, принятые общим собранием трудового коллективом в пределах его полномочий, являются обязательными для администрации, всех членов трудового коллектива.

3. Педагогический совет станции юннатов:

- рассматривает основные вопросы учебно-воспитательного процесса на станции юннатов;
- разрабатывает меры по совершенствованию содержания образования, внедрению инновационных технологий;
- принимает решение о переводе и выпуске обучающихся;
- обсуждает и утверждает планы работы станции юннатов;
- заслушивает информацию и отчеты педагогических работников станции юннатов и представителей организаций и учреждений, взаимодействующих со станцией юннатов, по вопросам образования и воспитания обучающихся; о проверке соблюдения санитарно-гигиенического режима станции юннатов; об охране здоровья и труда обучающихся и другие вопросы образовательной деятельности станции юннатов;
- принимает решения об исключении обучающихся из станции юннатов в установленном законом порядке;
- осуществляет другие функции, предусмотренные Положением о Педагогическом совете.

Педагогический совет созывается по мере необходимости, но не реже четырех раз в год. Для ведения протокола и организации делопроизводства из числа педагогов избирается секретарь Педагогического совета. Председателем Педагогического совета является директор станции юннатов. Решения Педагогического совета являются правомочными, если на его заседании присутствовало не менее двух третей состава, принимаются открытым голосованием, большинством голосов и являются обязательными для всех участников образовательного процесса. Решения Педагогического совета оформляются приказом директора станции юннатов. Организацию выполнения решений Педагогического совета осуществляет директор станции юннатов.